隐藏的病毒出现在世界上使用最广泛的研究植物中

许多研究结果可能受到最近描述的植物病毒的影响

一种以前不为人知的病毒似乎出现在世界上研究最多的植物物种中, de zandraket (Arabidopsis thaliana). 病毒的存在可能对研究项目产生深远的影响. 冰球突破官方平台和瓦赫宁根大学的研究人员 & 研究发现了这种病毒. In het vakblad New Phytologist 他们呼吁植物科学家测试他们的沙袋植物是否有病毒.

Zeer besmettelijk

找出病毒是如何影响植物的, 研究人员做了各种实验. Planten die geïnfecteerd waren, 结果表明,叶绿素含量较低,抗旱能力较好. 因为病毒不会产生任何明显的症状, 研究人员将其命名为拟南芥潜伏病毒1 (ArLV1).

研究人员发现,这种病毒很容易传播:40%的植物生长在受感染的沙粒上, 再次检测病毒阳性. 研究人员还成功地将病毒从受感染的沙坑传播到健康的沙坑植物.

Vervuiling van datasets

但是如何发现一种不会引起明显症状的病毒呢? 当研究人员试图分析来自不同沙粒的RNA时,它浮出水面. rna分子在蛋白质的产生中起着重要的作用.

冰球突破官方平台-onderzoeker dr. Ava Verhoeven, 几年前,他在瓦赫宁根研究一组被病毒感染的rna数据, 偶然发现乌得勒支的数据集也有类似的问题. Verhoeven:“在这两个数据集中,超过90%的RNA样本不是沙克特的, maar van iets anders. 在瓦赫宁根,未知的RNA已经与一个大型数据库中的RNA进行了比较. 很明显,它一定是一种未知病毒的RNA. En toen we 比较来自乌得勒支数据集的未知RNA和来自瓦赫宁根的病毒RNA, 原来是同一种未知的病毒.”

Dr. Ava Verhoeven在实验室里种植沙袋植物
Dr. Ava Verhoeven在实验室里种植沙袋植物. Foto: Laura Dijkhuizen.

Wereldwijd verspreid

瓦赫宁根的研究人员决定调查他们是否也能在其他研究人员在网上发布的数据集中发现病毒. 他们在8号发现了病毒的完整RNA,5%的数据集和近25%的各种可用的沙袋线, 是什么表明这种病毒已经在全世界传播了.

Veel werk en geld verspild

因此,Verhoeven确信病毒不仅在乌得勒支和瓦赫宁根产生了不可用的数据集. “沙坑是模型植物,”Verhoeven说. “现在冰球突破mg平台的出版物已经出版了, 许多同事表示,他们认识到数据集的问题. 他们以前只知道它是由这种病毒引起的.”

“含有少量植物rna的rna数据集很容易被认为是失败的. 研究结果通常不会发表,因此其他研究人员无法在网上找到. 因此,尽管病毒很普遍,但它仍然隐藏着. 因此,“受感染”数据集的实际百分比可能远远高于8,5 procent. 创建这些数据集已经花费了大量的时间和金钱, 而你却因为病毒而一无所有.”

Alle planten vooraf testen

通过测试来自荷兰和西班牙的野生植物, 研究人员发现这种病毒也存在于野外. 部分由于这个原因,这种病毒似乎已经在野外的沙袋植物中传播了很长一段时间,并最终进入了实验室. 由于研究人员交换了大量的沙粒种子,病毒很容易传播.

Verhoeven和他的同事建议研究人员在创建大型数据集之前测试他们的沙袋种子是否存在病毒. Verhoeven:“当然,你想要防止你用来研究的植物中突然出现病毒. 不仅仅是因为它可以生成不可用的数据集, 但也因为病毒可以以未知的方式影响植物. 因此,冰球突破mg平台提供了一个协议,每个研究人员可以很容易地测试病毒是否存在于他们的植物中.”

Publicatie

拟南芥潜伏病毒1,一种共生病毒广泛传播 Arabidopsis thaliana collections

Ava Verhoeven, Karen J. Kloth, Anne Kupczok, Geert H. Oymans, Janna Damen, Karin Rijnsburger, Zhang Jiang, Cas Deelen, Rashmi Sasidharan, Martijn van Zanten, René A. A. van der Vlugt

新植物学家,2022年9月8日 http://doi.org/10.1111/nph.18466